Ученые, анализируя образцы с разных городов мира, определили, что у каждого из них есть неповторимый набор бактерий и вирусов, рассказывает Naked Science.
Команда исследователей из Высшей школы медицинских наук при Корнеллском университете, Нью Йорк, США, еще в 2015 году создала международную платформу MetaSUB. Главной целью проекта был сбор, анализ и изучение микроорганизмов, населяющих общественные места больших городов — станции метро и автобусов, супермаркеты, стадионы, бизнес-центры, парки и места отдыха, которые ежедневно посещают тысячи жителей. Согласно с главной миссией, все желающие могли сотрудничать с MetaSUB, собирать образцы микрофлоры в больших и маленьких городах всего мира и отправлять их исследователям проекта для дальнейшего изучения. Таким образом, за шесть лет удалось собрать огромный международный каталог вирусов, бактерий, грибов и архей, многие из которых не были замечены наукой до этого дня.
Американские ученые, во главе с Кристофером Мейсоном, используя базу MetaSUB, изучили геномы микрофлоры из 60 городов и 32 стран мира. Для этого им понадобилось секвенировать с помощью «метода дробовика» 4700 полученных образцов, собранных в общественном транспорте, медицинских и публичных учреждениях, школах и просто на улице.
Было определено, что каждый город мира, подобно живому организму, имеет свой, характерный набор крохотных жителей. Более того, каждый из городов может легко называть себя мегаполисом, ведь количество одних только бактерий в несколько тысяч раз превышает количество горожан. Среди проанализированного материала ученые определили 4246 известных видов микроорганизмов, из которых только 31 вид оказался распространен глобально. Эти крохотные популяции встречались в 97 процентах образцов. Более того, 10 928 вирусов и 748 видов бактерий до сегодняшнего дня были неизвестны науке. Ученым еще предстоит классифицировать и изучить этих представителей микрофлоры.
Куратор проекта Кристофер Мейсон прокомментировал это: «Подумайте, каждый раз, спускаясь в метро или рассчитываясь где-то наличкой, вы, скорее всего, контактируете с еще не открытыми науке видами. Возможно, этот факт убедит вас внимательней относиться к собственному иммунитету — главной защите организма».
Самое интересное, что большинство городов имели свой собственный, неповторимый «микрослед». Состав микрофлоры, как отпечаток пальца человека, не повторялся у двух городов. Исследователи предположили, что им достаточно соскоба с обуви человека, чтобы установить место его проживания с точностью до 90 процентов.
Конечно, на то, как именно будет выглядеть набор бактерий, вирусов и грибов каждой индивидуальной экосистемы влияет множество внешних факторов, таких как особенности климата, влажность, высота над уровнем моря, плотность и численность населения, количество приезжих, мигрантов и просто туристов. Вместе с аэропортом, морским портом или званием «туристической мекки» ваш город получает также несколько тысяч неизвестных науке видов микроорганизмов.
Проект MetaSub позволяет не только открывать новые виды живых организмов, но также изучать формирование экосистем, влияние бактерий, вирусов и грибов на здоровье и жизнь человека, открывать вредоносные виды, контролировать появление новых потенциально опасных штаммов и искать новые методы лечения болезней, вызываемых ими.
Результаты работы представлены американскими исследователями в статье, опубликованной в журнале Cell.